Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMP2A6NFY4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms