Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF2A6NFQ2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms