Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms