Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRAMEF27A3QJZ7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRAMEF27A3QJZ7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms