Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms