Protein–RNA interactions for Protein: P60022

DEFB1, Beta-defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB1P60022 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 DFFB-201ENST00000338895 3105 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ARHGAP25-201ENST00000409030 2936 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CACNA2D2-206ENST00000479441 3453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SCN8A-215ENST00000638820 3359 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms