Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 OTOG-202ENST00000399391 8778 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 LRFN3-204ENST00000588831 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 PARP6-223ENST00000616176 2102 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 HNRNPR-201ENST00000302271 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 MEIS2-206ENST00000424352 2917 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 HERC2P9-203ENST00000528584 2947 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 AL139220.2-207ENST00000434244 2644 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 DACH2-202ENST00000373131 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 STARD13-201ENST00000255486 5798 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 STARD13-204ENST00000399365 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ZNF479Q96JC4 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms