Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 FAM90A17P-201ENST00000533716 1957 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 MOG-225ENST00000431798 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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