Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AP000229.1-201ENST00000608591 1979 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC105935.1-203ENST00000419183 600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 LDLRAD1-203ENST00000420619 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 FMR1-218ENST00000621447 1832 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK8P49336 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK8P49336 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK8P49336 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK8P49336 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK8P49336 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK8P49336 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK8P49336 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK8P49336 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK8P49336 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK8P49336 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK8P49336 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK8P49336 RHBDL2-201ENST00000289248 2129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CYP2B7P-202ENST00000593298 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK8P49336 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 SOX30-203ENST00000519442 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC139491.6-202ENST00000637171 2077 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms