Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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CUL4BQ13620 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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CUL4BQ13620 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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CUL4BQ13620 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CUL4BQ13620 HACD3-210ENST00000568793 1824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CUL4BQ13620 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CUL4BQ13620 TGM5-207ENST00000622115 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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