Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR3DP05423 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR3DP05423 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms