Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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USP35Q9P2H5 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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USP35Q9P2H5 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP35Q9P2H5 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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