Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms