Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 IL21R-201ENST00000337929 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 RHBDL2-201ENST00000289248 2129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 LINC01649-202ENST00000634255 1743 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 FAM184A-211ENST00000521531 3244 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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