Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AC023590.1-202ENST00000366457 781 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 HSPB11-204ENST00000371378 894 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AL391987.4-201ENST00000377547 439 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC074085.2-201ENST00000416734 428 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SKA1-203ENST00000417656 1095 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 PHBP11-201ENST00000420550 809 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 TRBV22-1-201ENST00000424543 337 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC002451.1-202ENST00000432265 771 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SNHG14-207ENST00000452731 1064 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 UCMA-202ENST00000463405 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC003072.1-201ENST00000510957 612 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC008915.2-201ENST00000570080 730 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 RPL37A-212ENST00000600880 425 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 Metazoa_SRP.198-201ENST00000610617 323 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC007450.4-201ENST00000614709 524 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC010776.3-201ENST00000617349 424 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC010325.1-203ENST00000636757 380 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 CXorf40A-203ENST00000422892 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 TUBAP-201ENST00000425085 1352 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 PRL-203ENST00000617911 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC100774.1-201ENST00000565581 1603 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SERPINA1-220ENST00000636712 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 VRK3-202ENST00000377011 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 DNM1L-220ENST00000549701 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 RPS21-202ENST00000370562 1002 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 ZNF451-205ENST00000370710 375 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 POLR1C-202ENST00000372344 1119 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SUMF1-203ENST00000405420 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 FAM45BP-201ENST00000408950 1074 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 RBM14-203ENST00000409372 876 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AP001610.1-201ENST00000411427 1116 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 LINC01849-201ENST00000414647 517 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC009237.11-201ENST00000425635 265 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC087163.1-201ENST00000430089 381 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AL049542.1-201ENST00000430231 278 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC018892.1-201ENST00000451098 265 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 CSRP1-219ENST00000533432 1149 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC017100.1-201ENST00000565978 1169 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC010601.1-201ENST00000569048 446 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 ZNF223-202ENST00000585552 541 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC015936.1-201ENST00000591013 1028 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC092327.1-201ENST00000596612 744 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 PDE4C-213ENST00000598111 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 AC020928.1-201ENST00000590750 1850 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 CREB5-204ENST00000396300 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 FRG1-201ENST00000226798 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 REG3A-201ENST00000305165 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 SRSF10-205ENST00000374452 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTF1AQ7RTS3 CDA-201ENST00000375071 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms