Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CUL4BQ13620 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CUL4BQ13620 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CUL4BQ13620 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CUL4BQ13620 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CUL4BQ13620 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CUL4BQ13620 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CUL4BQ13620 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CUL4BQ13620 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CUL4BQ13620 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CUL4BQ13620 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CUL4BQ13620 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CUL4BQ13620 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CUL4BQ13620 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CUL4BQ13620 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CUL4BQ13620 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 LINC01649-202ENST00000634255 1743 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 AFG3L2P1-201ENST00000521792 1763 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CUL4BQ13620 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CUL4BQ13620 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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