Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK8P49336 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK8P49336 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK8P49336 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK8P49336 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK8P49336 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK8P49336 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK8P49336 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK8P49336 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 CD74-203ENST00000377795 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC073862.3-201ENST00000624597 1648 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK8P49336 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 LINC00299-203ENST00000444688 537 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 VTI1BP1-201ENST00000486325 700 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK8P49336 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms