Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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HERC3Q15034 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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HERC3Q15034 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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HERC3Q15034 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 LINC01649-202ENST00000634255 1743 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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