Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL4BQ13620 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 PICART1-201ENST00000499842 2533 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL4BQ13620 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL4BQ13620 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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