Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 TUFT1-204ENST00000392712 2946 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 INO80-211ENST00000616814 4272 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 LAMB3-201ENST00000356082 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SUSD4-207ENST00000484758 2736 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 NFATC1-202ENST00000318065 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 COLQ-201ENST00000383781 2784 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ITGA4-203ENST00000397033 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 C1orf94-201ENST00000373374 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PTPN1-201ENST00000371621 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PDGFD-201ENST00000302251 4052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 OLFML3-202ENST00000369551 1934 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 UBIAD1-202ENST00000376810 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ERI2-208ENST00000564349 3657 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CANT1-202ENST00000392446 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 HACD3-210ENST00000568793 1824 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 DMBX1-202ENST00000371956 2882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ST6GAL1-215ENST00000457772 3947 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 DDX56-204ENST00000431640 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 FERMT1-204ENST00000536936 3229 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AL365181.2-201ENST00000606343 3222 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 BTNL3-201ENST00000342868 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CTBP1-AS2-202ENST00000505364 2423 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 TNFSF10-202ENST00000420541 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PROS1-202ENST00000394236 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CTSK-201ENST00000271651 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 GP1BA-201ENST00000329125 2501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 OPN1MW3-201ENST00000599405 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 LINC02211-203ENST00000642022 2816 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 NBPF3-203ENST00000342104 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 DDX39B-214ENST00000458640 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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LSAMPQ13449 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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LSAMPQ13449 DUOXA1-208ENST00000558996 2684 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 MIS12-206ENST00000611091 2691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SPDYE5-202ENST00000624640 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SEC61A1-201ENST00000243253 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 MIR9-3HG-203ENST00000546186 2718 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 MRPL48-201ENST00000310614 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PPP1R26P5-201ENST00000416640 3664 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 DIS3-205ENST00000545453 3651 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ZNF773-205ENST00000599847 5832 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PLEKHG6-204ENST00000449001 3111 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CEACAM19-201ENST00000358777 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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