Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 PABPC1P2-201ENST00000471997 1805 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2C1P98194 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 STPG4-201ENST00000294947 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 C1QTNF3-202ENST00000382065 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 C3orf56-201ENST00000624688 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 TBC1D3F-201ENST00000620210 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms