Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 COL19A1-205ENST00000620364 6233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 C17orf51-201ENST00000391411 7914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC023355.1-202ENST00000612262 4242 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PLEKHA5-203ENST00000429027 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PARP15-205ENST00000483793 4439 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms