Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 NXPE4-201ENST00000375478 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 CST11-202ENST00000377009 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 TOMM5-202ENST00000377773 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 GSTM2P1-201ENST00000405166 654 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AL078621.2-201ENST00000419351 698 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 SVILP1-203ENST00000450581 486 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC109466.1-201ENST00000517508 804 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 IFI27L1-203ENST00000553664 647 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC018868.2-201ENST00000559655 1259 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AP005264.6-203ENST00000586882 1050 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 NOSIP-204ENST00000596358 1005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC007450.4-201ENST00000614709 524 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 TNNI2-206ENST00000617947 699 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 MIPEPP1-201ENST00000413533 2027 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 PMP22-203ENST00000395938 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 CREBRF-203ENST00000520420 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 OR6M1-201ENST00000309154 1053 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC019349.1-201ENST00000411759 476 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms