Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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