Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC105415.1-201ENST00000509015 1416 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 NEK11-213ENST00000511262 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 ART2P-201ENST00000415521 822 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AL512444.1-201ENST00000419644 480 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 IGHV7-56-201ENST00000518372 351 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AP003096.1-201ENST00000565199 503 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SNRPD2-203ENST00000585392 379 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC106774.4-201ENST00000600799 409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC004832.1-204ENST00000610737 1018 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC245369.3-201ENST00000624687 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 GPHN-202ENST00000459628 1723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 LAMTOR2-203ENST00000368305 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 HSD17B3-201ENST00000375262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 FTH1P19-201ENST00000402402 528 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC074085.2-201ENST00000416734 428 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AL356289.1-203ENST00000439795 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 OPRM1-211ENST00000518759 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 PDE4C-213ENST00000598111 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC104521.1-201ENST00000598582 279 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 RPL37A-212ENST00000600880 425 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC009061.2-202ENST00000602596 696 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AL353801.2-201ENST00000436877 1444 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 C16orf46-202ENST00000378611 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 PRY-201ENST00000303728 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 PRY2-201ENST00000303804 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 PRYP3-201ENST00000343584 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 THYN1-202ENST00000352327 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 FCER1A-201ENST00000368114 765 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC106748.1-201ENST00000454801 384 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC067942.2-201ENST00000506227 1268 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AL132780.2-203ENST00000555294 589 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 AC105105.4-201ENST00000610389 713 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1SQ13698 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 LILRA2-204ENST00000391738 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms