Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 AC139491.6-202ENST00000637171 2077 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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