Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMTNP53814 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms