Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 FPGT-202ENST00000370898 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 SOX30-203ENST00000519442 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMPOP42166 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms