Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 KRT40-201ENST00000377755 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 UGT1A1-201ENST00000305208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 SLC25A6P1-201ENST00000412123 775 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 RPL19P20-201ENST00000415648 591 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 ZNF662-202ENST00000422021 436 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 AC007312.1-201ENST00000427493 258 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 IGHV3-6-201ENST00000518407 347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 AC108102.1-201ENST00000606528 548 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 GJB1-202ENST00000374022 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 CD33-202ENST00000391796 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 AC002519.2-201ENST00000563575 539 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 AC009061.2-202ENST00000602596 696 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 HYLS1-201ENST00000356438 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 SGCE-201ENST00000265735 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 CASC4P1-201ENST00000456608 1312 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 GSDMB-201ENST00000309481 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 MAGED2-205ENST00000375060 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 ACR-201ENST00000216139 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 FPGT-202ENST00000370898 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1P21675 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 RPUSD4-208ENST00000533628 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 MEFV-209ENST00000541159 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 TACR1-202ENST00000409848 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 AC007622.1-201ENST00000488371 535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 CIRBP-AS1-201ENST00000585832 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 GPHN-202ENST00000459628 1723 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 PAX6-217ENST00000481563 1587 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1P21675 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms