Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 TNFSF13B-201ENST00000375887 2582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 DNAI2-202ENST00000446837 2474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 LINC01254-202ENST00000567609 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 KIF28P-202ENST00000504864 3064 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ATP2C2-201ENST00000262429 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 TRPC3-205ENST00000513531 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ZNF215-207ENST00000610573 1503 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 DLX5-201ENST00000222598 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SIGLEC10-209ENST00000525998 1841 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AL354704.1-201ENST00000629369 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 WDR37-201ENST00000263150 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ARSG-201ENST00000448504 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 INTS8-217ENST00000523731 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SCML1-204ENST00000398080 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 PMS2-201ENST00000265849 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 PEX1-204ENST00000438045 3329 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 UBA3-202ENST00000361055 2154 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ANXA4-201ENST00000394295 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 FER1L6-AS1-201ENST00000518567 2315 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 CNTROB-202ENST00000563694 3705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 MROH7-204ENST00000409996 2977 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ACSL6-207ENST00000379264 6539 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 CLINT1-210ENST00000530742 3344 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 STPG4-201ENST00000294947 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SLC38A1-206ENST00000549049 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 HKR1-204ENST00000544914 2854 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 IRF5-208ENST00000473745 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AKAP1-208ENST00000572557 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 LRRC37A7P-201ENST00000583900 2759 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC053503.6-201ENST00000623864 1843 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 FOSB-204ENST00000585836 3550 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ANO1-207ENST00000530676 3289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 PRDM11-204ENST00000530656 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SLC10A1-201ENST00000216540 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SNRNP48-201ENST00000342415 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 LMX1A-202ENST00000342310 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms