Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AQP7-205ENST00000379507 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 FAS-204ENST00000355740 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 CPT1C-203ENST00000392518 2910 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 HTR2C-203ENST00000371951 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC112Q8NEF3 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms