Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AL135960.1-201ENST00000422216 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 MKL1-213ENST00000620651 3757 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms