Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 RHBDL2-201ENST00000289248 2129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms