Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 COL9A1-202ENST00000357250 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 C12orf56-201ENST00000333722 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AC018645.3-201ENST00000628855 2646 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 SEC24B-203ENST00000504968 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 CEP170-204ENST00000366544 6805 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AC037459.3-201ENST00000521025 2750 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 PDIK1L-204ENST00000619836 4252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 NPEPPS-201ENST00000322157 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 IKZF1-210ENST00000439701 3572 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 DLGAP2-AS1-201ENST00000518009 1810 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 SHPRH-211ENST00000629427 7338 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 MAGEA11-202ENST00000355220 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 UBE3B-203ENST00000434735 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 CRBN-215ENST00000639284 2223 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 RCHY1-201ENST00000324439 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 GNAT1-201ENST00000232461 2417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 TIAM2-201ENST00000275246 2491 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 PBOV1-201ENST00000527246 2506 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 UEVLD-213ENST00000543987 2503 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 TMEM164-202ENST00000372068 5566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 TIAM2-202ENST00000318981 5916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 WDR70-201ENST00000265107 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 FGF23-201ENST00000237837 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 RHD-210ENST00000622561 3007 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 LPIN2-201ENST00000261596 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 STX16-205ENST00000361830 4318 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 OR10H5-202ENST00000642092 7044 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 FDXACB1-201ENST00000260257 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 FUT6-201ENST00000286955 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 DNASE1-202ENST00000407479 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 DPY19L2P3-201ENST00000414296 2326 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 CTAGE7P-201ENST00000435712 2436 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
IFITM1P13164 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms