Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ZNF789-209ENST00000483089 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 RAI2-202ENST00000360011 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 UGT1A3-201ENST00000482026 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R18-202ENST00000399199 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 TMEM174-201ENST00000296776 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 CEP83-201ENST00000339839 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC134682.1-201ENST00000569285 3377 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 MKX-202ENST00000419761 3638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ARL13B-201ENST00000303097 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 DPY19L2P3-201ENST00000414296 2326 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 PLSCR1-201ENST00000342435 2233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 UNC13D-202ENST00000412096 3648 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 MTMR2-202ENST00000352297 3350 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 PAX6-201ENST00000241001 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 GLYR1-201ENST00000321919 3772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 GPATCH2L-212ENST00000557263 1458 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 VDR-208ENST00000550325 3925 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 UEVLD-213ENST00000543987 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 RP2-201ENST00000218340 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 RNF113A-201ENST00000371442 1353 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 IQCB1-202ENST00000349820 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 DRC1-201ENST00000288710 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 C9orf64-201ENST00000314700 2067 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 UCK1-202ENST00000372210 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC104435.2-201ENST00000478745 866 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 KCTD7-209ENST00000640385 4118 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 METTL13-201ENST00000361735 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC084855.2-201ENST00000559400 2393 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 CEP89-207ENST00000591863 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D3P5-203ENST00000586223 3083 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 DDX56-204ENST00000431640 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 TK2-206ENST00000527800 2687 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 DLC1-210ENST00000512044 3758 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 LILRB2-204ENST00000391749 2286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 GPT2-202ENST00000440783 4228 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms