Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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