Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK8P49336 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms