Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 PSMD5-201ENST00000210313 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 HIST1H2BH-201ENST00000619466 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 DDX11L2-201ENST00000437401 1398 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 RCBTB2-206ENST00000544904 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 PCSK7-215ENST00000540028 3332 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 AP003108.3-201ENST00000623765 2234 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 ELP4-202ENST00000379163 1700 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 AOC2-201ENST00000253799 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 TSFM-204ENST00000454289 2192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 FOXD2-AS1-201ENST00000445551 2509 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 AQP7-205ENST00000379507 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 SUOX-203ENST00000394109 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCAP28676 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 ZUFSP-202ENST00000368576 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 RNF113A-201ENST00000371442 1353 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 SCML1-201ENST00000380041 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 PBOV1-201ENST00000527246 2506 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms