Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

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Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTC1Q2NKJ3 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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