Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 PABPC1P2-201ENST00000471997 1805 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 RABL2B-201ENST00000354869 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 LINC01561-201ENST00000369071 2176 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 CHST4-202ENST00000539698 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 TRIM32-203ENST00000450136 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 CSF3R-204ENST00000373104 2953 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 OVOL1-201ENST00000335987 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 PLK4-210ENST00000514379 3060 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 LPXN-203ENST00000528954 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 TUFT1-202ENST00000368848 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 C3orf56-201ENST00000624688 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF3-202ENST00000382065 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 CDK16-201ENST00000276052 3016 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 PRKAG1-205ENST00000547306 1531 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 246 ms