Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms