Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNPO3Q9Y5L0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms