Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FARP1Q9Y4F1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FARP1Q9Y4F1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms