Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDGFL3Q9Y3E1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms