Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
THRAP3Q9Y2W1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
THRAP3Q9Y2W1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms