Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BTRCQ9Y297 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms