Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERGIC3Q9Y282 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms