Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms