Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms