Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNND2Q9UQB3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms